它们的区别如下：
1、形态不同
酒曲是在经过强烈蒸煮的白米中，移入曲霉的分生孢子，然后保温，米粒上便会茂盛地生长出菌丝，此即酒曲。酵母是一种单细胞真菌，并非系统演化分类的单元。一种肉眼看不见的微小单细胞微生物。
2、用途不同
酒曲和麦芽同时作为原料糖，用来制造酒、甜酒和豆酱等。最常提到的酵母为酿酒酵母（也称面包酵母），自从几千年前人类就用其发酵面包和酒类，在发酵面包和馒头的过程中面团中会放出二氧化碳。
3、生长环境不同
酒曲中所生长的微生物主要是霉菌。大多数霉菌繁殖最适宜的温度为25～30℃，在0℃以下或30℃以上。酵母属于简单的单细胞真核生物，易于培养，且生长迅速，在低于水的冰点或者高于47℃的温度下， 酵母细胞一般不能生长，最适生长温度一般在20～30℃。
